Ochranárska genomika kamizíka a svišťa

Opis

Predmetom zákazky je poskytovanie služieb pre potreby hodnotenia genetickej diverzity, populačnej štruktúry, hybridizácie a dlhodobého genetického monitoringu kamzíka vrchovského (Rupicapra rupicapra) a svišťa vrchovského (Marmota marmota). Predmet zákazky zahŕňa aj spracovanie referenčných vzoriek kamzíka vrchovského alpského na účely hodnotenia hybridizácie populácií kamzíka vrchovského tatranského. Predpokladaný počet spracovaných vzoriek kamzíka vrchovského (Rupicapra rupicapra) a svišťa vrchovského (Marmota marmota) je maximálne 200 ks. Tento počet nemusí byť dodržaný a môže sa znížiť v závislosti od reálnej dostupnosti biologického materiálu. Služby zahŕňajú kontrolu kvality DNA vzoriek, prípravu genomických knižníc, sekvenovanie DNA metódami sekvenovania novej generácie (NGS), bioinformatické spracovanie veľkoobjemových sekvenačných dát, identifikáciu genetických variantov, tvorbu genotypových matíc a návrh genetických markerov využiteľných pre dlhodobý monitoring populácií. Podrobný opis, rozsah, požiadavky a lehoty plnenia sú uvedené v návrhu rámcovej dohody.